Amplificação Cruzada de Marcadores Moleculares Ssr e Diversidade Genética Entre Genótipos de Coffea Canephora e Coffea Arabica.
Nome: LUDYMILA BRANDÃO MOTTA
Tipo: Dissertação de mestrado acadêmico
Data de publicação: 16/02/2012
Orientador:
Nome |
Papel |
|---|---|
| TAÍS CRISTINA BASTOS SOARES | Orientador |
Banca:
| Nome |
Papel |
|---|---|
| EVELINE TEIXEIRA CAIXETA | Examinador Externo |
| FÁBIO DEMOLINARI DE MIRANDA | Examinador Externo |
| MARCELO ANTONIO TOMAZ | Examinador Interno |
| MARIA AMÉLIA GAVA FERRÃO | Examinador Externo |
| TAÍS CRISTINA BASTOS SOARES | Orientador |
Resumo: O objetivo do presente estudo foi avaliar a amplificação cruzada de marcadores de regiões microssatélites (SSR) em C. canephora a partir de primers desenvolvidos originalmente para C. arabica e estimar a diversidade entre 7 genótipos de C. arabica e 10 de C. canephora (SSR e ISSR). Dos 72 primers testados para a amplificação cruzada, 40 (55,5%) foram transferidos com sucesso para C. canephora. Destaca-se que desses, 21 primers foram polimórficos. O número de alelos/primer foi de 2,63 (2-4), o que corresponde a um total de 50 alelos. O valor médio de PIC no presente estudo foi de 0,33 (0,1239 a 0,6261) e a heterozigosidade média observada (H0) foi de 0,36 (0,1-0,6667). Dentre os 40 primers que amplificaram, 19 (47,5%) apresentaram padrão monomórfico. Os primers que apresentaram a amplificação de marcas bem definidas (81%), geraram um total de 307 marcas polimórficas e 24 monomórficas. Esse total de 331 marcas foi utilizado nas análises de similaridade entre os materiais genéticos. A análise da diversidade genética apontou intervalos de dissimilaridade que variaram de 0,22-0,44 entre os genótipos de café conilon, 0,02-0,28 entre os de café arábica e 0,49-0,6 entre os genótipos das duas espécies na análise conjunta. Utilizou-se como ponto de corte no dendrograma o valor de 0,60, com isso, foram formados quatro grupos: G1, 10 genótipos de C. arabica; G2, 5 genótipos de C. canephora do grupo Conilon; G3, 1 genótipo de C. canephora do grupo Robusta e G4, 1 genótipo de C. canephora do grupo Robusta. O agrupamento formado foi condizente com as origens de cada grupo. Altas estabilidades das bifurcações foram encontradas através da análise de bootstrap por 1000 reamostragens. O número ótimo de marcadores binários foi estimado e correspondeu a 224 alelos. A utilização de marcadores moleculares dos tipos SSR e ISSR no estudo de diversidade foi eficiente na distinção dos genótipos de C. arabica e C. canephora. Os 40 primers transferidos para C. canephora poderão contribuir para estudos moleculares / genéticos do cafeeiro conilon.
